大白菜ENT基因家族的鉴定与生物信息学分析

Identification and bioinformatics analysis of ENT gene family in Chinese cabbage

核苷转运蛋白(nucleoside transporter,ENT)是一类具有跨膜运输核苷和核苷类似物的功能蛋白。为深入研究大白菜 ENT 基因家族的功能,利用生物信息学方法对大白菜基因组中的 ENT 基因家族成员进行鉴定,并对其基因组信息、蛋白生理生化特征、基因结构、保守结构域、系统进化树等方面进行了研究。结果表明,在大白菜基因组中共鉴定到12个 ENT 基因,通过系统发育树分析,可以将12个 ENT 基因分为2类;对大白菜ENT蛋白氨基酸序列多重比对和蛋白跨膜域的分析表明,BrENT蛋白存在11个跨膜域,为跨膜蛋白;通过MEME软件对大白菜ENT蛋白motif的预测还发现了14个比较保守的motif。染色体分析表明, ENT 基因在大白菜10条染色体上不均匀分布,而且存在明显的串联重复现象,推测串联复制是 ENT 基因家族基因扩增的主要方式,研究结果为在基因组范围内研究 ENT 基因的功能奠定了基础。