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西瓜全基因组SSR位点的特征及其在比较遗传作图和遗传多样性分析中的应用 被引量:1

Genome wide characterization of simple sequence repeats in watermelon genome and their application in comparative mapping and genetic diversity analysis
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摘要 目的与意义:随着新一代全基因组测序技术的快速发展,越来越多的物种开发了大量的覆盖全基因组的SSR标记.虽然在西瓜上也开发了一些SSR标记,并已经在连锁图谱和遗传多样性研究中得到应用,但仍存在多态性低、基因组覆盖率低等问题.本研究从西瓜全基因组水平分析了不同类型SSR序列的分布及频率.并开发了覆盖全基因组的SSR标记,同时通过电子PCR的方法确定了在甜瓜、黄瓜中通用的SSR分子标记,并利用这些通用SSR标记进一步明确了西瓜与黄瓜以及甜瓜3个物种之间的染色体共线性关系.本研究同时筛选了32对高多态性SSR标记对134份西瓜材料进行了遗传多样性及群体结构分析.
出处 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2019年第8期180-181,共2页 China Cucurbits And Vegetables
基金 河南农业大学科技创新基金(KJCX2015A11) 河南农业大学特聘教授启动基金(30600860)
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