鱼类Foxl3基因的生物信息学分析

为进一步探明Foxl3的结构、功能信息,及其在鱼类性别决定和分化中的作用,利用生物信息学方法对欧洲黑鲈、青鳉、斑马鱼和虹鳟的Foxl3蛋白进行同源性、蛋白质理化性质、二级结构、功能结构域和三级结构分析。结果表明:欧洲黑鲈与青鳉、斑马鱼同源性较高,和虹鳟相似度不高,只有79%;鱼类的Foxl3蛋白分别编码269、264、260和296个氨基酸;该蛋白定位于细胞核,无明显信号肽和跨膜结构;主要的二级结构元件是α-螺旋和无规则卷曲,且α-螺旋所占百分比:虹鳟>青鳉>欧洲黑鲈>斑马鱼,无规则卷曲所占百分比:欧洲黑鲈>虹鳟>青鳉>斑马鱼;均包含1个Forkhead家族(FH superfamily)功能结构域。