CD133^+和CD133^-胶质母细胞瘤肿瘤干细胞的lncRNA表达谱

目的探索CD133^+与CD133^-胶质母细胞瘤干细胞的长链非编码(lnc)RNA表达的差异。方法重注释CD133^+与CD133^-胶质母细胞瘤干细胞的基因芯片,提取lncRNA表达谱,通过基因本体论分析及加权共表达网络分析探索重要的差异分子及关键调控lncRNA,并使用肿瘤基因组图谱计划数据库及临床样本验证其临床意义。结果CD133^+与CD133^-的胶质母细胞瘤干细胞表达谱共1250个差异表达的转录本,其中lncRNA151个;主要组织相容性复合体(MHC)Ⅱ分子在CD133^+细胞低表达,长链脂肪酸延伸酶2翻译RNA与CD133表达、异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变密切相关,并可作为胶质母细胞瘤患者预后风险的预测分子。结论CD133^+干细胞关键驱动lncRNA长链脂肪酸延伸酶2翻译RNA,并在临床证实了其对预后的预测意义。