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水稻全生育期均一化cDNA文库的构建和鉴定 被引量：22

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摘要 以优良杂交水稻的恢复系明恢63为材料,构建覆盖水稻基因组的cDNA文库,用于功能基因组的研究.选择水稻全生育期过程中的9个时期的不同组织和病原诱导的组织分别构建了15个定向cDNA文库.依据基因组DNA饱和杂交的原理,将从15个独立的cDNA文库中提取的质粒混合,并与固定在磁珠上具有互补性的2份基因组DNA亲和体系饱和杂交,收集杂交组分中的质粒并重新转化大肠杆菌,获得全生育期均一化cDNA文库.该文库平均插入片段1.4 kb,含62000个克隆子.反向Northern杂交显示,该文库收集了众多表达丰度极低的基因以及特异表达的基因.对文库中随机的10750个克隆进行了测序,序列分析比较后获得6399条非重复的EST(expressed sequence tag)序列,非重复序列占59.5％,.目前,用该文库制作的cDNA芯片已被用于功能基因组的研究.
作者 储昭晖 彭开蔓 张利达 周斌 魏君 王石平
机构地区 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
出处 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第21期1656-1662,共7页 Chinese Science Bulletin
基金 国家自然科学基金(批准号:30070396) 国家重点基础研究发展规划(批准号:G2000016202)资助项目.
关键词 水稻 均一化 CDNA文库 DNA芯片 全生育期 序列测定 功能基因组
分类号 S511 [农业科学—作物学] Q785 [生物学—分子生物学]
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同被引文献352

引证文献22

二级引证文献177

科学通报
2002年 第21期

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