新城疫病毒昌吉株F基因的生物信息学特征分析

通过分子生物学方法对分离毒NDV-CJ株的F基因(第1~374位)进行扩增、测序和序列分析,结果表明该分离株为VIId基因分型,是一种偏碱性、不稳定和可溶性蛋白质。具有信号肽(虚序列为MGPRPSTKNPVPMMLTVRVALVLSCICPANS)、16个磷酸化位点(9种保守性蛋白激酶位点)、1个糖基化位点,其二级结构以α-螺旋(34.71%)和无规则卷曲(43.80%)为主,表明该蛋白既具有稳定蛋白骨架作用,也具有较高的可塑性。