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高通量测序数据识别拼接错误方法
被引量:
2
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摘要
本文基于思想对识别错误序列拼接的算法进行优化,增加了运算速率,降低了CPU内存消耗,提高了识别序列错误拼接的效率。基因组序列拼接是指待检测基因组序列的物种,使用Sanger等技术手段参照各测序片段之间的contigs重新生成reads片段并组建待测物种的基因组序列的一种方法,本文采用多种方法识别错误拼接并比较其优缺点。
作者
范佳雯
机构地区
哈尔滨师范大学
出处
《电子技术与软件工程》
2019年第23期146-147,共2页
ELECTRONIC TECHNOLOGY & SOFTWARE ENGINEERING
关键词
基因组拼接
高通量测序
错误拼接
识别
分类号
TP3 [自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
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电子技术与软件工程
2019年 第23期
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