猪胸膜肺炎放线杆菌铁离子转运ABC蛋白的生物信息学分析

为了解猪胸膜肺炎放线杆菌fbp C基因转录翻译后的ferric transporter ATP-binding subunit的结构和功能,根据Gene Bank中猪传染性胸膜肺炎放线杆菌fbp C基因碱基序列和氨基酸序列,对fbp C基因及其编码的铁转运ABC蛋白进行生物信息学分析利用。结果显示,App fbp C由1068个核苷酸所组成,编码355氨基酸的蛋白质。该蛋白质的分子量为(MW)39523.2,理论等电点(pI)为6.26。为以外膜蛋白,与转铁蛋白一起共同完成转铁功能。蛋白序列与App不同血清型的同源性很高,与其它的放线杆菌进化上处于同一分支,与嗜血杆菌的亲缘关系高于大肠杆菌。结果表明,猪胸膜肺炎放线杆菌铁离子转运ABC蛋白为一非跨膜蛋白,其离子转运与ATP结合有关。