摘要
高通量测序技术和生物信息学的发展极大的促进了山羊分子生物学研究。山羊参考基因组的不断完善以及基因组重测序技术的应用,在全基因组水平上发现了大量的遗传变异信息(SNP、Indel和CNV),丰富了山羊分子群体遗传学研究利用的分子标记。综述了山羊参考基因组组装和全基因组变异图谱的构建及其在山羊上的研究进展,以期为进一步利用分子遗传标记进行山羊的各种性状的遗传基础研究和遗传资源保护利用提供科学依据和参考。
The development of high-throughput sequencing technology and bioinformatics has greatly promoted the research of goat molecular biology.With the continuous improvement of goat reference genome and the application of whole genome re-sequencing technology,a large number of genetic variation information has been found at the whole genome level(SNP,Indel and CNV),which enriches the available molecular markers used in goat molecular population genetics research.This paper reviews the research and application progress of goat reference genome and whole genome variation map on goat,aiming at providing scientific basis and reference for further genetic basic research and genetic resource conservation and utilization of goat traits by using molecular genetic markers.
作者
李晓凯
范一星
乔贤
张磊
王凤红
王志英
王瑞军
张燕军
刘志红
王志新
何利兵
李金泉
苏蕊
张家新
LI Xiao-kai;FAN Yi-xing;QIAO Xian;ZHANG Lei;WANG Feng-hong;WANG Zhi-ying;WANG Rui-jun;ZHANG Yan-jun;LIU Zhi-hong;WANG Zhi-xin;HE Li-bing;LI Jin-quan;SU Rui;ZHANG Jia-xin(College of Animal Science,Inner Mongolia Agricultural University,Hohhot 010018;Key Laboratory of Mutton Sheep Genetics and Breeding,Ministry of Agriculture,Hohhot 010018;Engineering Research Center for Goat Genetics and Breeding,Inner Mongolia Autonomous Region,Hohhot 010018;Inner Mongolia Jinlai Livestock Technology Co.,Ltd,Hohhot 010018)
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期175-184,共10页
Biotechnology Bulletin
基金
国家自然科学基金项目(31660639,31860637)
国家绒毛用羊现代农业产业技术体系(CARS-39-06)
内蒙古自治区研究生教育创新计划资助项目(B20171012901Z)
内蒙古农业大学“双一流”学科创新团队建设人才培育项目(NDSC2018-01)。
关键词
山羊
参考基因组
遗传变异
单核苷酸多态性
插入缺失
拷贝数变异
goat
reference genome
genetic variation
single nucleotide polymorphism
insertion and deletion
copy number variation