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胶质母细胞瘤相关基因的生物信息学分析

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摘要 目的筛选胶质母细胞瘤(GBM)相关的基因并进行生物信息学分析。方法从基因表达公共数据库中下载GSE65626表达谱数据集,运用BRB-ArrayTools软件筛选差异表达基因(DEGs),然后对差异基因进行基因本体(GO)功能富集分析和Pathway富集分析,并建立与分析pathway互作网络。结果共筛选出572个DGEs,包括上调基因209个,下调基因363个。GO富集分析发现差异基因涉及细胞外基质聚合与分解、轴突引导、血管新生、细胞粘附与迁移等生物过程。Pathway富集分析结果表明ECM-受体互作、粘着斑、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、紧密连接等pathways显著富集。互作网络分析挖掘出的核心pathways包括细胞骨架调节、黏着连接、粘着斑和MAPK信号通路。结论GBM组织和正常脑组织之间的基因表达谱不同,为进一步探索GBM病理发生的分子机制提供了潜在的基因靶标。
出处 《西南军医》 2020年第3期238-240,261,共4页 Journal of Military Surgeon in Southwest China
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