长链非编码RNA HOTAIR在乳腺癌患者中表达及其临床意义

目的采用生物信息方法探讨长链非编码RNA同源异型框基因翻译基因间RNA(HOTAIR)在乳腺癌患者中的表达及其与患者预后关系。方法检索Oncomie数据库中乳腺癌患者HOTAIR基因表达的相关芯片数据。根据HOTAIR表达水平分为高低表达组,并用Kaplan-Meier Plotter数据库中生存数据构建生存曲线,比较高低表达组总生存期(OS)。采用TCGA数据分析乳腺癌患者HOTAIR基因变异情况。同时选取72例乳腺癌患者,q-PCR检测肿瘤组织中HOTAIR表达情况并与患者预后做相关分析。结果Oncomine数据库分析显示,HOTAIR在乳腺癌组织中表达水平明显高于正常乳腺组织(P<0.05);高低表达组239153_at(HR=1.29,95%CI:0.94~1.76,P>0.05)和1557051_s_at(HR=0.92,95%CI:0.67~1.29,P>0.05)两个数据集OS差异无统计学意义(P>0.05),但数据集239153_at呈现出高表达患者生存期较短的趋势。TCGA数据中HOTAIR在乳腺癌中拷贝数异常率为0.1%,HOTAIR表达水平在各种突变情况下差异无统计学意义(P>0.05)。且癌组织显著高于癌旁组织(P<0.05),高表达组生存期显著低于低表达组(HR=1.45,9%CI:1.08~2.32,P<0.05)。结论HOTAIR在乳腺癌中高表达,且可能与患者预后相关,可作为乳腺癌患者预后潜在的分子标志物。