免疫应答基因JCHAIN在乳腺癌中差异表达及其与预后的相关性

目的分析TCGA数据库中人类乳腺癌组织与癌旁组织基因之间的差异表达,获得免疫相关特异性标志基因,为乳腺癌的分子分型、免疫治疗等提供参考依据。方法利用TCGA数据库1 075例乳腺癌样本中的RNA-Seq数据结合患者的完整生存时间信息,运用人类蛋白质表达图谱(HPA)数据库分析与乳腺癌预后良好相关的JCHAIN基因,利用Ualcan和HPA分析免疫应答基因JCHAIN在乳腺癌组织中mRNA和蛋白质水平的变化,进一步采用基因表达谱动态分析(GEPIA)数据库分析JCHAIN mRNA在乳腺癌中差异表达及与预后的相关性。结果与正常组织比较,JCHAIN在乳腺癌癌组织中表达降低(P=0.000),其低表达与乳腺癌预后不良相关,浸润性小叶癌较浸润性导管癌、黏液腺癌的JCHAIN表达增加(P=0.000),绝经前较绝经后患者JCHAIN表达增加(P=0.044);JCHAIN表达与性别相关,女性乳腺癌患者较男性乳腺癌患者表达增高,但较正常人明显降低(P<0.000);高加索人群较非裔美国人乳腺癌中JCHAIN表达水平高(P=0.014);亚洲人与高加索人、非裔美国人比较JCHAIN表达水平无统计学差异。生存分析结果发现,JCHAIN高表达组总生存期较低表达组显著延长(P=0.002);JCHAIN高表达组无疾病进展生存期与低表达组无显著差异(P=0.067)。结论免疫应答基因JCHAIN在乳腺癌组织中呈低表达,且与乳腺癌患者预后不良相关。