烟草bZIP基因家族的生物信息学分析

碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)转录因子主要参与植物的生长发育及响应生物和非生物胁迫应答等过程。本研究利用生物信息学手段,通过烟草基因组数据库,鉴定分析烟草bZIP基因家族成员,并对其在在理化分析、系统进化、蛋白二级与三级结构、保守基序以及亚细胞定位等方面进行了系统分析。结果表明,烟草至少存在20个bZIP基因家族。理化性质分析表明,烟草bZIP基因家族的氨基酸数目在135-8111aa之间,等电点范围为4.84-9.76,大部分bZIP蛋白为酸性蛋白质。通过亚细胞定位发现其主要存在于细胞核内,少部分存在于细胞质中。通过二级、三级结构分析,发现bZIP蛋白主要通过α-螺旋、延伸链、β-折叠和无规则卷曲四种主要结构单元维持自身结构。,对bZIP蛋白进行系统进化分析可将其分为7个亚族。它们的序列具有高度保守性,共包括10个保守基序。研究结果为烟草bZIP基因家族的逆境胁迫应答反应调控机制研究奠定了基础。