鸭痘的诊断和一株鸭痘病毒部分基因的序列分析

为了了解广西地区鸭痘病毒的流行情况,试验采用实时荧光定量PCR、基因克隆和序列分析的方法,对采自广西河池市宜州某养鸭场患病鸭的痘斑组织进行病原学检测。结果表明:从痘斑组织中检测出的病毒为鸭痘病毒,将其命名为Hechi株。用自行设计的引物P1/P2扩增出大小约为577 bp的Popr基因片段,与预期大小一致。经MEGA 6.0软件分析,Hechi株属于基因5.1亚群;与国内鸡痘疫苗株(282E4)、广西大新株(daxin)、鹅源毒株(YNE)、鸭源毒株(YNY)的氨基酸位点比较有11个氨基酸位点发生改变,与国外参考株相比有5个氨基酸位点改变较大;与YNE、YNY、282E4、daxin株的核苷酸序列同源性分别为87.4%、87.6%、87.6%和99.8%,氨基酸序列同源性分别为91.9%、92.4%、92.4%和100%。说明目前广西地区流行的鸭痘病毒很可能来源于YNY、282E4这2株毒株。