松辽黑猪与北京黑猪杂交后代MyoD1基因的SNP位点分析

为探究松辽黑猪与北京黑猪杂交后代黑猪MyoD1基因的单核苷酸多态性(SNP)位点与肉质性状的关系,试验提取松辽黑猪与北京黑猪杂交后代黑猪的背最长肌基因组DNA,应用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)方法分析MyoD1基因的SNP位点,并对产生SNP位点的不同基因型进行了序列分析和系统进化树比较。结果表明:PCR扩增获得了大小为631 bp的MyoD1基因片段,经DdeⅠ酶酶切,产生631 bp、256 bp+375 bp、631 bp+256 bp+375 bp 3种带型;对MyoD1基因的重组质粒PCR产物进行DdeⅠ酶酶切,产生631 bp、256 bp+375 bp 2种带型;松辽黑猪与北京黑猪杂交后代黑猪MyoD1基因存在3个SNP位点,分别是217 bp处存在C>T突变位点,375 bp处存在G>T突变位点,413 bp处存在T>C突变位点,且位于375 bp处的G>T SNP位点导致DdeⅠ酶酶切位点丢失;松辽黑猪与北京黑猪杂交后代黑猪MyoD1基因与GenBank中野猪(登录号为U12574.1)基因序列处于同一分支,而与其他物种的同源性较低,具有独特的物种特异性。