接触抗生素对雏鸡肠道菌群多样性影响的研究

接触抗生素可以影响雏鸡体内的动态微生物群,这可能使得功能途径的组成和底物利用率产生变化。这里将120只30天龄的京红鸡根据四种处理方式随机分成7个实验组:未接触抗生素的对照鸡;接触恩诺沙星、地克珠利的雏鸡,以及接触恩诺沙星、地克珠利1:1混合物14天后停药15天的雏鸡。7组实验组在8个时间点(4次接触抗生素及4次停药期)收集粪便样本以用于肠道菌群16s r RNA测序的深入研究。独立分类分析表明各组微生物组成差异显著(P<0.01)。在微生物组成方面,与对照组相比,微生物门类的丰富程度上,接触抗生素的雏鸡粪便中硬壁菌、放线杆菌、热敏菌、疣状杆菌、乳酸菌族、S24-7和棒状杆菌减少(P<0.01)。使用未观测状态重建进行群落系统发育研究(PICRUSt)分析表明,由于抗生素反应性微生物(P<0.01)的存在导致微生物群代谢途径存在显著差异,尤其是与细胞生长和死亡、免疫系统疾病、碳水化合物代谢和核苷酸代谢有关的途径。口服恩诺沙星、地克珠利及其混合物改变了雏鸡的肠道菌群组成及其体内的微生物代谢谱,并具有持续的影响(在停药期间),组织其恢复成原本的群落并导致了新的群落的形成。