姜黄素对心肌梗死重要生物学过程以及信号通路影响的分析

目的:基于生物信息学分析姜黄素作用于心肌梗死的关键分子机制,为心肌梗死的治疗提供新的靶点。方法:通过NCBI-GEO数据库,我们下载了姜黄素作用于HL-60白血病细胞的高通量基因表达谱GSE16160,用R语言筛选了与对照组相比姜黄素在HL-60细胞中的差异表达基因,并将差异表达基因与Genecard数据库中与心肌梗死相关度大于5的基因取交集。利用Venny2.1.0软件绘制韦恩图,得到共有的关键差异基因。利用DAVID数据库对关键基因进行KEGG通路分析。结果:下载GEO数据集GSE16160,利用R语言分析筛选出差异表达基因:利用Genecard分析筛选出与心肌梗死相关的652个差异基因,通过韦恩图分析出共有的差异表达基因;通过DAVID在线功能富集分析差异基因,显示的信号通路主要为HIF-1信号通路等。结论:通过分析姜黄素GEO数据库的表达谱,我们预测了姜黄素在心肌梗死主要调控凋亡以及生物氧化反应等生物学过程,主要调控HIF-1信号通路。