基于数据挖掘比较慢性阻塞性肺疾病模型动物易感基因

目的:分析常用慢性阻塞性肺疾病(慢阻肺)模型动物的易感基因差异,以优化选择造模动物。方法:在大鼠基因组数据库(RGD)检索人类、小鼠、大鼠等物种的基因组学数据,进行慢阻肺易感基因富集分析,通过Ensembl基因组数据库比较不同物种间基因的异同,最后采用PolySearch2挖掘慢阻肺易感基因相关的文献。结果:在RGD发现人类、小鼠、大鼠的慢阻肺易感基因数目最接近,3个物种在KEGG通路、生物表型、分子功能方面均有较大相似度。已发表文献中,关于慢阻肺易感基因Z分数>8.00的基因有14个。结论:人类、小鼠、大鼠在慢阻肺的相关疾病、涉及的信号通路及作用靶点等方面具有相似性,又有所差异。