基于数据挖掘和网络药理学分析旋覆代赭汤治疗反流性食管炎的效用机制

Efficacy Mechanism of Xuanfu Daizhe Decoction in the Treatment of Reflux Esophagitis Based on Data Mining and Network Ppharmacology

目的:基于数据挖掘和网络药理学方法,从分子水平探讨旋覆代赭汤治疗反流性食管炎(RE)的药理学作用机制。方法:从GEO数据库获得RE的差异表达基因(DEGs)。基于TCMSP平台检索旋覆代赭汤的化学成分及作用靶点,应用String、Perl语言等生物信息学工具筛选出旋覆代赭汤与RE的交集靶点,并构建“化合物-交集靶点”网络及PPI网络。应用Cytoscape中的MCODE和Cytohubba插件提取PPI网络的功能模块及Hub基因进行生物学功能注释。将Hub基因与旋覆代赭汤作用于RE涉及的信号通路合并构建“Hub基因-KEGG”网络图。结果:从GSE68698数据集获得186个REDEGs。筛选得到165个有效化合物,71个与RE有关的作用靶点和7个核心Hub基因。MCODE功能模块及Hub基因功能注释显示,参与血管生成、细胞增殖、MAPK级联反应、转录因子结合、蛋白磷酸酶结合、泛素蛋白连接酶结合等多种生物学过程,调控癌症途径、PI3K-AKT信号通路、灶性粘连、MAPK信号通路等。结论:旋覆代赭汤通过调控机体的炎症级联反应,发挥防治RE的效用。