摘要
关键蛋白质是各种生命活动的重要参与者,在生命生存和繁殖中起着至关重要的作用.基于邻域的中心性方法是识别关键蛋白质的常用方法.提出基于邻域组合的中心性方法(CNC),将度中心性方法(DC)与局部平均连接中心性方法(LAC)进行组合,并引入参数α调节DC方法的影响权重.实验表明,与现有其它邻域中心性方法相比,CNC方法提高了静态和动态蛋白质相互作用网络的关键蛋白质识别率.
Essential protein is important participants in various life activities and plays a vital role in the survival and reproduction of life.The neighborhood-based centrality method is the important method to identify essential protein.A combined neighborhood-based centrality method was proposed,which combines degree centrality(DC)and local average connectivity(LAC).Meantime,the parameterαto adjust the weight of the DC was introduced.The experiment shows that compared with other neighborhood-based centrality methods,the CNC improves the essential protein recognition rate in static and dynamic proteinprotein interaction networks.
作者
孙静
李彬
李文彬
杨勃
潘理
SUN Jing;LI Bin;LI Wenbin;YANG Bo;PAN Li(School of Information Science and Engineering,Hunan Institute of Science and Technology,Yueyang 414006,China)
出处
《湖南理工学院学报(自然科学版)》
CAS
2021年第2期52-56,共5页
Journal of Hunan Institute of Science and Technology(Natural Sciences)
基金
湖南省科技计划项目(2018TP2022)
湖南省自然科学基金项目(2019JJ40105)
湖南省教育厅科学研究项目(19B231)
湖南省教学改革研究项目(HNJG-2020-0670)
湖南省研究生教学改革项目(2020JGYB236)。
关键词
关键蛋白质
邻域
中心性方法
essential protein
neighborhood
centrality method