期刊文献+

无精子症患者Y染色体序列标签位点-聚合酶链反应与二代测序检测的比较

下载PDF
导出
摘要 目的观察无精子症患者Y染色体序列标签位点-聚合酶链反应(STS-PCR)与二代测序(NGS)检测的差异。方法对133例无精子症患者,采用STS-PCR检测Y染色体AZF微缺失的15个STS位点,包括AZF a区的sY84/sY86、AZF b区的sY124/sY127/sY128/sY133/sY134/sY143/sY1192、AZF c区的sY152/sY239/sY242/sY254/sY255、AZF b/c区的sY145,同时采用NGS检测Y染色体基因组拷贝数变异(CNVs),并统计分析两种检测方法的差异。结果133例无精子症患者中,Y染色体AZF微缺失异常17例(12.78%),其中缺失14个STS 1例,占5.88%;缺失12个STS 3例,占17.65%;缺失11个STS 1例,占5.88%;缺失6个STS 1例,占5.88%;缺失5个STS 1例,占5.88%;缺失4个STS 2例,占11.76%;缺失2个STS 1例,占5.88%;缺失1个STS 7例,占41.18%。Y染色体CNVs异常12例(9.02%),其中既重复又缺失3例,占25%;重复(dup)4例,占33.33%;缺失(del)5例,占41.67%。Y染色体AZF(15个STS)微缺失的结果与CNVs缺失结果相比,差异有统计学意义(P<0.05),而Y染色体AZF(经典6个STS)微缺失的结果与CNVs缺失结果相比,差异无统计学意义(P=0.357)。结论STS-PCR和NGS互有补充,前者不能检测出重复,后者可能漏检小片段缺失。在无精子症遗传因素的实验室检查中,可以考虑采用NGS作为筛选,而采用STS-PCR作为验证。
出处 《临床检验杂志》 CAS 2021年第5期350-353,共4页 Chinese Journal of Clinical Laboratory Science
基金 宁夏回族自治区自然科学基金(2020AAC03495)。
  • 相关文献

参考文献1

二级参考文献25

  • 1Charlesworth B, The evolution of chromosomal sex determination and dosage compensation. Curr Bio1,1996, 6(2) :149-162.
  • 2Rice WR. Evolution of the Y sex chromosome in animals. Bioscience, 1996,46 ( 5 ) : 331-343.
  • 3Lahn BT, Page DC. Four evolutionary strata on the human X chromosome. Science, 1999, 286(5441) :964-967.
  • 4Bachtrog D. A dynamic view of sex chromosome evolution. Curt Opin Genet Dev, 2006, 16(6) :578-585.
  • 5Aitken R J, Marshall Graves JA. The future of sex. Nature, 2002,415 (6875) :963.
  • 6Graves JA. The degenerate Y chromosome-can conversion save it? Reprod Fertil Dev, 2004,16 ( 5 ) : 527-534
  • 7Skaletsky H, Kuroda-Kawaguchi T, Minx PJ, et al. The malespecific region of the human Y chromosome is a mosaic of discrete sequence classes. Nature, 2003, 423 (6942) :825-837.
  • 8Rozen S, Skaletsky H, Marszalek JD, et al. Abundant geue conversion between arms of palindromes in human and ape Y chromosomes. Nature, 2003, 423(6942) :873-876.
  • 9Hughes JF, Skaletsky H, Pyntilova T, et al. Conservation of Ylinked genes during human evolution revealed by comparative sequencing in chimpanzee. Nature, 2005, 437 (7055) : 100-103.
  • 10Charlesworth B, Charlesworth D. The degeneration of Y chromosomes. Philos Trans R Soc Lond B. Biol Sci. 2000:355 ( 1403 ) : 1563-1572.

共引文献8

相关作者

内容加载中请稍等...

相关机构

内容加载中请稍等...

相关主题

内容加载中请稍等...

浏览历史

内容加载中请稍等...
;
使用帮助 返回顶部