高、低产蛋量新疆伊犁鹅性腺轴转录组分析:基因结构分析与新基因发掘注释

本研究旨在探究高、低产蛋量新疆伊犁鹅性腺轴组织的转录组差异表达基因,为完善新疆伊犁鹅基因结构和发掘新基因提供参考。实验选取健康状况良好、饲养条件一致的3岁龄高、低产蛋量新疆伊犁鹅各4只,利用高通量测序技术对高、低产蛋量新疆伊犁鹅性腺轴组织进行单核苷酸多态性(SNP)的查找、可变剪切筛查、基因结构优化和新转录本预测。结果显示:在高、低产蛋量新疆伊犁鹅性腺轴中共筛选出1 048 575个SNP位点,64 209个可变剪切,优化了11 383个基因。在高、低产蛋量新疆伊犁鹅性腺轴组织中共筛选到3 119个新基因,获得注释的基因902个;差异表达新基因64个,其中49个差异新基因表达上调,15差异新基因表达下调,通过比对发现这些基因分别与核苷酸切除修复、VEGF信号通路、泛素介导的蛋白水解、RNA转运、氨基酸的生物合成以及粘着斑等信号通路相关。本结果为伊犁鹅基因组信息的进一步完善及基因功能的挖掘提供了一定的数据基础,为全面解析伊犁鹅产蛋量的分子机制提供了参考依据。