非ST段抬高型急性冠状动脉综合征相关基因的生物信息学分析

目的对非ST段抬高型急性冠状动脉综合征(NSTE-ACS)相关的表达基因进行筛选及功能分析,为筛选NSTE-ACS发病机制相关的分子标志物提供理论基础。方法从高通量基因表达(GEO)数据库中选取GSE60993;并通过GEO2R进行生物信息学分析,筛选出差异表达基因;利用DAVID对差异表达基因进行基因本体(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析;通过STRING数据库和Cytoscape软件构建差异表达基因对应的蛋白质相互作用网络,并利用MCC算法获取具有高度连接性的关键基因。结果通过对NSTE-ACS差异表达基因的筛选,共获得327个差异表达基因,包括上调基因190个、下调基因137个。差异表达基因主要涉及核糖体、哮喘、抗原处理和呈递、同种异体移植排斥反应、病毒性心肌炎等相关信号通路,并通过蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络和Cytoscape软件筛选出10个具有高度连接性的关键基因,包括核糖体蛋白S6(RPS6)、X连锁核糖体蛋白S4(RPS4X)、核糖体蛋白L13A(RPL13A)、核糖体蛋白L18(RPL18)、核糖体蛋白L14(RPL14)、核糖体蛋白L24(RPL24)、核糖体蛋白L17(RPL17)、Aurora激酶B(NSA2)、核糖体蛋白37A(RPL37A)、核糖体蛋白S13(RPS13)。结论 NSTE-ACS差异基因可能主要通过核糖体通路、抗原处理和呈递通路及病毒性心肌炎等相关信号通路来发挥相关其作用。