基于GEO数据库多芯片联合分析与网络药理学探索黄芪治疗心肌缺血再灌注损伤的机制研究

目的基于GEO数据库多芯片联合分析与网络药理学相结合,探索黄芪治疗心肌缺血再灌注损伤(Myocardial ischemia-reperfusion injury, MIRI)的作用机制。方法通过GEO数据库获得GSE108940与GSE58486芯片数据,利用R语言综合分析筛选出MIRI的差异表达基因,使用Genecards与OMIM获取MIRI的靶点,在TCMSP和BATMAN-TCM中获取黄芪的有效成分与靶点,进行PPI分析,随后导入至Cytoscape 3.8.1中,分析得出核心靶点,利用DAVID数据库进行GO与KEGG富集分析,对核心成分及靶点进行CDOCKER对接验证。结果总共筛选出黄芪的12个有效成分及15个关键靶点,GO富集分析主要涉及分子功能(Molecular Function, MF)条目71个,生物学过程(Biological Process, BP)条目173个,细胞组分(Cellular Component, CC)条目31个,KEGG信号通路主要有27条,CDOCKER结果显示黄芪的核心成分与核心靶点展示出了较好的亲和力。结论黄芪通过抑制炎症、抑制细胞凋亡等生物学途径干预MIRI,机制可能主要与NOD样受体信号通路、TNF信号通路、Toll样受体信号通路等信号通路有关。