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基于系统药理学和分子对接解析湘NCP2方防治新冠肺炎的作用机制 被引量:3

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摘要 目的基于系统药理学和分子对接解析湖南省预防新冠肺炎2号方(简称湘NCP2方)防治新冠肺炎的作用机制。方法基于SCIFINDER、TCM@Taiwan、TCMSP等药理学网络数据库检索湘NCP2方的化学成分和作用靶点;在Genecards和OMIM中检索SARS⁃CoV⁃2感染人体相关靶点,String 11.0等数据库收集靶点之间的蛋白质相互作用信息,Cytoscape3.7.2构建化合物⁃靶点网络,DAVID进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析;选取核心有效成分,Autodock Vina软件将其与SARS⁃CoV⁃23CL水解酶和ACE2进行分子对接。结果有效成分⁃作用靶点网络包含267个作用靶点和121种有效成分,共同调控的靶点为CASP3、FOS、CREB1、CCL2、IL10、BCL2L1、IFNG、CXCL10、DPP4。生物过程的富集主要涉及炎症、免疫等,细胞组分富集主要与外泌体等有关,分子功能主要与酶结合、药物反应和病毒受体活性有关。KEGG通路富集筛选得到6条信号通路(P<0.05),涉及TNF信号通路、T细胞受体信号传导途径、Toll样受体信号通路、B细胞受体信号传导途径、NF⁃κB信号通路等。核心有效成分与SARS⁃CoV⁃23CL水解酶和ACE2展现了良好的对接活性。结论湘NCP2方可通过炎症、免疫等生物过程和信号通路,以及作用SARS⁃CoV⁃23CL水解酶、ACE2等SARS⁃CoV⁃2相关蛋白来防治新冠肺炎。
出处 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期255-263,共9页 Chinese Traditional Patent Medicine
基金 国家自然科学基金项目(81774126,81973670) 湖南省自然科学基金项目(2016JJ2095,2017JJ3232) 湖南省中医药防治新型冠状病毒肺炎科研专项(KYGG06,KYGG07) 广东省中医特色专科建设项目(2012) 深圳市中医特色专科建设项目(2018)。
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