从江香猪CD53基因的组织表达和结构变异多态性研究

基于比较基因组学,在猪源白细胞表面抗原CD53基因中发现一段265 bp的结构变异(Structure Variant,SV)。为了研究该结构变异在不同猪种中的多态性变化,本研究采用RT-q PCR检测从江香猪各组织中CD53基因m RNA的表达差异,并建立了结构变异CD53-I4-SV265的PCR检测方法,应用建立的检测方法分析从江香猪与大白猪结构变异的多态性分布。结果发现,CD53基因在肺脏中表达量最高,其次在脾脏与肠中大量表达,在背最长肌与垂体中表达量最低;在从江香猪与大白猪中,该结构变异的频率分布存在明显的差异,从江香猪以缺失的DD基因型为主,大白猪均为杂合的ID基因型,从等位基因频率上看,香猪缺失的D等位基因频率明显高于大白猪。在结构变异区域中检测到多种剪接调控元件(ESE/ISE),可能影响CD53基因的表达效率和转录本加工。本文研究结果表明,CD53基因中的结构变异CD53-I4-SV265可能与香猪较强的抗病力有关。