山麻鸭OC-116基因克隆、生物信息学及组织表达谱分析

实验旨在探究OC-116(Ovocleidin-116)基因在山麻鸭蛋壳形成过程中的作用,应用SMART-RACE技术克隆获得了长度为2129 bp的山麻鸭OC-116基因cDNA全长序列,运用生物信息学软件对该基因和蛋白的特征进行分析,结果显示:该基因编码蛋白的分子式为C2710H4331N865O927S12,属于不稳定蛋白,其编码的蛋白中甘氨酸(16.5%)、丙氨酸(11%)、丝氨酸(10.2%)含量较高。蛋白的二级结构中,α螺旋(Hh)占比0.47%、β折叠(Ee)占比17.64%、无规卷曲(Cc)占比81.89%,且包含肽信号,不含跨膜结构;系统进化树显示山麻鸭与绿头鸭、黑天鹅和棕硬尾鸭的亲缘关系最近;在mRNA的水平上,OC-116基因在山麻鸭14种组织中均有不同程度的表达,其中在垂体、子宫部和峡部中的表达量极显著高于其他组织。子宫部和峡部分别是蛋壳矿化形成和蛋壳膜形成部位,表明OC-116基因在山麻鸭蛋壳的形成过程中扮演着重要的角色。