摘要
Na^(+)/H^(+)逆向转运(Na^(+)/H^(+)exchange or antiporter, NHX)蛋白家族的氨基酸序列具有Na^(+)/H^(+)exchange蛋白结构域,在植物生长发育和非生物胁迫应答中发挥重要作用。为探究甜橙(Citrus sinensis)NHX基因家族的生物学特性,本研究从甜橙基因组中鉴定出6个NHX基因家族成员,并对其理化性质、基序组成、进化关系、表达谱等进行分析。结果显示,CsNHXs编码蛋白的长度为407~543个氨基酸,分子量为44.71~59.97 ku;所有CsNHXs非均匀地分布在5条染色体上,均具有保守的Na^(+)/H^(+)exchange结构域;蛋白质二级结构分析结果表明,甜橙NHX蛋白主要以α-螺旋和无规则卷曲为主。与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)的NHX蛋白一起构建的系统进化树聚类为3个亚群,甜橙NHX蛋白分布在Endo和Vac亚群中。顺式作用元件预测分析结果表明,CsNHXs启动子区域包含多个植物的生长发育响应元件、激素响应元件和逆境响应元件。转录组数据分析结果表明,CsNHXs在甜橙不同组织中的表达存在差异性,总体上分为特异性表达和普遍性表达。本研究系统分析了甜橙NHX基因家族,为进一步阐明甜橙NHX基因家族的功能提供了理论依据。
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2022年第7期35-42,共8页
Jiangsu Agricultural Sciences
基金
国家自然科学基金(编号:32060667、32160731)
江西省教育厅科学技术研究项目(编号:GJJ190758、GJJ180758)。
