基于生物信息学分析CDH6基因在胃癌组织中的表达及临床意义

目的:钙粘附素家族成员cadherin-6(CDH6)异常激活与多种癌症的发生发展密切相关,本研究利用生物信息学技术分析CDH6在胃癌中的表达情况及功能。方法:从癌症基因组图谱-胃腺癌(TCGA-STAD)数据集获得RNA转录本数据及临床数据,比较不同分组间CDH6的表达水平。使用Cox回归分析和Kaplan-Meier法评估CDH6表达对胃癌预后的意义。使用cBioPortal筛选TCGA-STAD中与CDH6共表达的基因并对其进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。使用基因集富集分析(GSEA)分析与CDH6表达相关的标志基因集。使用CIBERSORT和TIMER分析CDH6与免疫细胞浸润和免疫相关基因之间的相关性。结果:CDH6在胃癌中高表达并与胃癌的恶性程度呈正相关。CDH6高表达是胃癌不良预后的独立危险因素,与较差的总生存期相关。胃癌中CDH6功能富集主要与肿瘤的浸润、转移相关,标志基因集富集主要与上皮间充质转化相关。胃癌中CDH6的表达与多种免疫细胞及免疫相关基因相关。结论:CDH6的表达可能被多种免疫细胞释放的炎症因子所调控,进而通过EMT过程在胃癌的发生发展中发挥作用,是胃癌潜在的不良预后标志物和免疫治疗靶点基因。