百蕊草LRR-RLKs基因的鉴定与生物信息学分析

Identification and bioinformatics analysis on Thesium chinense LRR-RLKs genes

以百蕊草(Thesiumchinense Turcz)为材料,根据硝酸银诱导的转录组数据,PCR克隆到两条LRR-RLK基因,通过测序、生物信息学分析、荧光定量PCR等技术对两条基因进行分析。结果发现,两条基因全长分别为1278 bp与2115 bp,分别编码425和704个氨基酸,命名为TcLRR1和TcLRR2;TcLRR1与拟南芥EFR基因一致性最高,TcLRR2与水稻Xa21一致性最高;TcLRR2具有完整的LRR-RLK蛋白结构(亮氨酸重复域、信号肽、跨膜结构域、激酶域),而TcLRR1缺乏激酶域;TcLRR1与TcLRR2在非胁迫条件下的组织表达模式一致,都在叶片中表达最高。综上所述,TcLRR2可作为百蕊草抗逆相关的LRR-RLK候选基因进行后续的深入研究。