基于全基因组测序及平均核苷酸一致性分析鉴定1株哥伦比亚分枝杆菌

目的通过全基因组测序技术结合平均核苷酸一致性分析鉴定1株哥伦比亚分枝杆菌。方法1株分离自系统性红斑狼疮患者皮肤溃疡处的分枝杆菌,经抗酸染色初步鉴定、常规细菌培养获得菌株,采用质谱技术进行菌种鉴定,对分离菌株进行DNA提取和全基因组测序及生物信息分析。结果皮肤溃疡分泌物标本直接涂片抗酸染色呈阳性;分泌物经7 d培养可见细小菌落(编号MC230),抗酸染色阳性;质谱鉴定未获得菌种信息;MC230基因组大小为5671138 bp,GC含量为67.93%;MC230与哥伦比亚分枝杆菌模式菌株CECT 3035的平均核苷酸一致性分析(OrthoANI)值为98.05%。结论全基因组测序技术结合平均核苷酸一致性分析可准确实现哥伦比亚分枝杆菌鉴定。