利用SSR分子标记构建甜菜登记品种的分子身份证

Construction of molecular identity cards of sugar beet registration varieties using SSR molecular markers

通过构建111份甜菜登记品种的分子身份证,促进甜菜品种DUS测试标准体系的建立,实现甜菜品种的快速检索与比对,为甜菜品种指纹鉴定和溯源管理提供理论依据。利用22对简单重复序列(SSR)核心引物,基于最适的取样策略对来自国内外不同地区的111份甜菜登记品种进行遗传多样性分析以及分子身份证构建。结果显示,22对引物共检测到101个等位基因,每对引物检测出3~7个等位基因,平均为4.59个;Shannon多样性指数(I)为0.60~1.73,平均为0.95;Nei s期望杂合度(H_(e))为0.41~0.79,平均为0.56;PIC值范围为0.91~0.99,平均值为0.96,22对引物可用于区分甜菜品种。利用UPGMA聚类分析,22对引物将111份材料划为3个类群(G1~G3),聚类结果大致与其地理来源一致;通过获得的等位基因计算遗传距离,111份甜菜品种的遗传距离范围为0.059~0.564,平均值为0.325,甜菜品种间具有一定的遗传多样性。基于最少引物区分最多品种的原则,通过UPGMA聚类分析,仅用6个SSR引物组合可将全部材料区分。结果表明,基于6对SSR引物扩增的结果,通过数字与英文的形式,使用在线二维码软件构建的111份甜菜登记品种的分子身份证,丰富了甜菜品种指纹图谱的可视化形式,从而提高了品种鉴定的效率,保护育种者及消费者权益。