早期糖尿病肾病和糖尿病视网膜病变的基因调节

目的:通过生物信息学方法寻找早期糖尿病肾脏病和糖尿病视网膜病变的基因变异,探索早期糖尿病肾病与糖尿病视网膜病变共同基因。方法:从GEO数据库下载与早期糖尿病肾病和糖尿病视网膜病变有关的芯片,对数据进行标准化处理,利用R语言中的“limma”筛选出差异基因,筛选标准为log FC的绝对值>1,P<0.05的基因作为差异基因,然后用R语言中的“ClusterProfiler”对筛选的差异基因进行功能GO分析以及KEGG信号通路分析并对糖尿病肾病的差异基因进行了蛋白-蛋白相互作用分析以及功能模块的分析。结果:通过取log FC的绝对值>1,P<0.05,在早期糖尿病肾脏病中发现了122个差异基因。在糖尿病视网膜病变中两套数据差异基因个数分别为2 205个和15个。早期糖尿病肾脏病和糖尿病视网膜病变共有40个相同基因,这些基因在糖尿病肾病中下调的基因有4个,上调的基因有36个,在糖尿病视网膜病变中上调的有11个基因,下调的基因有29个基因。结论:早期糖尿病肾脏病和糖尿病视网膜病变均有不同程度的基因变异参与疾病进展,并且早期糖尿病肾脏病和糖尿病视网膜病变具有40个相同的差异基因包括SRPX2、ART4、SRGN、COL8A1、ITGA1和CYP1B1等,或许这些差异基因能够促进糖尿病微血管病变发生发展,为糖尿病肾脏病和糖尿病视网膜病变早期诊断提供新靶点。