基于网络药理学和分子对接技术探讨圣愈汤治疗骨关节炎的作用机制

Study on Mechanism of Shengyu Decoction in Treating Osteoarthritis Based on Network Pharmacology and Molecular Docking

目的采用网络药理学和分子对接技术探讨圣愈汤治疗骨关节炎(OA)的作用机制。方法利用TCMSP数据库,筛选获得圣愈汤的活性成分、药物靶点;在GEO数据库筛选后选取OA相关的3个芯片,获得OA差异基因,利用PERL软件OA差异基因与圣愈汤药物靶点取交集,利用Cytoscape 3.8.1软件绘制“活性成分-交集靶点”调控网络及交集靶点蛋白互作(PPI)网络图,根据中介中心性(BC)、接近中心性(CC)和节点数目(DC)筛选出圣愈汤治疗OA的主要活性成分和关键靶点;利用R语言中Bioconductor插件对交集靶点进行GO生物功能与KEGG通路富集分析;最后使用AutoDock Vina软件将筛选出的主要活性成分和关键靶点进行分子对接,评估其结合活性。结果在GSE 55457、GSE 29746、GSE 51588芯片中,OA分别有1770、2342、4532个差异基因;共筛选出56个圣愈汤的活性成分,98个圣愈汤治疗OA的交集靶点,其中IL-6、VEGFA、MMP9、MYC、JUN等为关键靶点,涉及TNF、AGE-RAGE、IL-17、Toll样受体等多条信号通路,富集生物学过程主要为对脂多糖的反应、血管新生的调节、调节缺氧环境;分子对接结果显示圣愈汤主要活性成分与关键靶点受体蛋白稳定结合并发挥显著作用。结论圣愈汤可能通过TNF、Toll样受体、IL-17等信号通路,从炎症、血管生成等方面治疗OA。