如何解析灭绝古生物与现生亲缘物种的功能基因组差异?

1背景2022年10月3日,瑞典进化遗传学家斯万特·帕博(Svante Pääbo)荣获本年度诺贝尔生理学与医学奖,使得地质学和生物学交叉而成的古基因组研究成为众人瞩目的焦点.帕博教授通过对已灭绝的尼安德特人及丹尼索瓦人的基因组测序,发现这些已灭绝古人类与智人祖先之间存在古老的基因流动(Fu et al.,2016;Prüfer et al.,2017),使学界对人类的演化历史有了全新的理解.与灭绝古人类对解剖学上的现代人有遗传贡献类似,已研究的多个灭绝动物物种或种群也有部分基因至今仍存在于现生生物的基因组中(Barlow et al.,2018;Sheng et al.,2019).现已灭绝的古菱齿象基因组,甚至包含非洲象祖先、猛犸象及非洲森林象三个物种的血统,是不同物种多次杂交的产物(Palkopoulou et al.,2018).