2个保种群和1个选育群绍兴鸭群体遗传学研究

本研究以绍兴鸭2个保种群体(A、B组)及神丹2号选育群体(C组)为实验对象,利用全基因组重测序数据分析这3个绍兴鸭群体的遗传多样性和群体遗传结构,挖掘不同保种年限以及保种与选育绍兴鸭群体之间分子种质特性差异。结果表明,神丹2号选育群体和A保种群体间的遗传关系较近。连锁不平衡分析显示选育群体具有较高的连锁程度。保种群体B的LD衰减速度低于A群体,A、B、C群体的平均近交系数分别为0.153 2、0.158 2、0.052 2,2个保种群体已经有一定程度的近交,需要予以重视。通过遗传分化分析,神丹2号选育群体相较于A保种群体,共筛选出了76个差异候选区域,定位到了418个候选基因(top5为标准)。候选基因显著富集到GnRH信号通路、MAPK信号通路、糖代谢合成和分解、亚油酸及亚麻酸代谢、钙信号通路、VEGF信号通路等信号通路,并筛选出CACNA1C、FGF3、FGF4、PLCG2等与繁殖相关的基因。