摘要
目的在人类肿瘤基因组(TCGA)公用数据库中寻找可作为子宫颈癌生物标记物的微小RNAs(miRNAs),进行风险评估。方法查找并下载TCGA数据库中所有子宫颈癌患者miRNAs的表达矩阵数据集和子宫颈癌患者的临床资料数据集,利用R语言中相关函数将子宫颈癌患者的miRNAs表达数据集和临床生存数据集参数一一对应合并整理。筛选子宫颈癌患者的差异性miRNAs,对差异性表达中上调的miRNAs,分析与患者临床不良预后相关的miRNAs,进一步通过Cox多因素回归分析建立风险评估模型。结果与正常组织比较,子宫颈癌组织中有134个miRNAs存在差异表达,其中表达下调的miRNAs有59个,表达上调的miRNAs有75个。36个miRNAs的高表达与预后不良相关。进一步建立Cox回归模型,筛选出10个miRNAs组合(包括hsa-mir-155、hsa-mir-16-1、hsa-mir-1307、hsa-mir-3150b、hsa-mir-642a、hsa-mir-3651、hsa-mir-33b、hsa-mir-942、hsa-mir-16-2、hsa-mir-331)预测子宫颈癌不良预后。结论筛选出的10个miRNAs可成为预测子宫颈癌不良预后的生物标记物。
出处
《中国妇幼保健》
CAS
2022年第24期4568-4571,共4页
Maternal and Child Health Care of China
基金
湖北省咸宁市自然科学基金项目(2021ZRKX045)。