多重耐药鲍曼不动杆菌耐药基因组测序与同源性分析

目的分析多重耐药鲍曼不动杆菌(MDRAB)耐药基因和基因同源性,为临床合理使用抗菌药物、制定医院感染防控策略提供依据。方法采用BD Phoenix-100全自动细菌鉴定及药敏分析仪对23株MDRAB进行鉴定及抗菌药物敏感性试验,用MALDI Biotyper全自动微生物质谱仪复核结果;利用Illumina HiSeq 4000系统进行全基因测序,使用glimmer3软件对基因组组装,使用tRNAscan-SE、RNAmmer和Rfam数据库对tRNA、rRNA和sRNA进行识别;根据菌株基因组序列,进行多位点序列分型(MLST),应用MEGA X version 10.1生物信息软件依据16S rDNA序列进行系统发育分析。结果药敏结果显示,14种药物耐药率为100%,仅米诺环素和多黏菌素B耐药率低于50%;根据全基因测序技术分析耐药基因,共检出36种耐药基因,除ANT(3″)基因检出率为30.43%,Vibrio cholerae varG基因检出率为21.74%,AAC(6′)基因检出率为4.35%,其余均高于50%。bla_(OXA-23)、bla_(OXA-66)和bla_(ADC-30)耐药基因检出率为100%,blaTEM-1耐药基因检出率为95.7%,未检出bla_(SHV)、bla_(IMP)、bla_(VIM)基因;MLST分型(Pasteur)分析结果显示23株菌株全部属于ST2一种序列分型,MLST分型(Oxford)分析结果显示23株菌株来自7个序列分型。系统发育分析显示23株菌和Acinetobacter baumannii strain ATCC 19606进化距离近,而与醋酸钙不动杆菌进化距离远。但菌株18A独立为一支,其他22株菌与Acinetobacter baumannii strain ATCC 19606进化距离更近。结论我院检出的MDRAB对常用抗菌药物高度耐药,携带多种耐药基因,且菌株之间存在同源性,应加强院感防控。