新型冠状病毒肺炎疫情发生前及疫情期间广州市手足口病肠道病毒的流行病学及型别分析

目的对比了解新型冠状病毒肺炎(COVID-19)发生前及疫情期间广州市手足口病肠道病毒的分子流行病学特征。方法 2019年1月至2021年12月, 采集到于广州市妇女儿童医疗中心就诊的手足口病住院或门诊疑似患儿的标本共73 740份, 其中2019年10 243份, 2020年24 568份, 2021年38 929份。采用实时荧光定量聚合酶链反应进行肠道病毒通用型、肠道病毒71型(enterovirus 71, EV71)、柯萨奇病毒A组(Coxsackie virus A group, CA)16检测, 并选取EV71和CA16双阴性而肠道病毒通用型为阳性的标本进行型别鉴定。结果 2019年10 243份同时进行肠道病毒通用型、EV71、CA16检测的手足口病标本中, 肠道病毒通用型阳性6 590份(64.34%), EV71阳性37份(0.36%), CA16阳性1 107份(10.81%), 非EV71非CA16肠道病毒阳性5 446份(53.17%)。2020年1 450份同时进行肠道病毒通用型、EV71、CA16检测的手足口病标本中, 肠道病毒通用型阳性476份(32.83%), EV71阳性1份(0.07%, 10月检测到), CA16阳性22份(1.52%), 非EV71非CA16肠道病毒阳性453份(31.24%);仅进行肠道病毒通用型检测的23 118份标本中, 阳性1 450份(6.27%)。2021年2 572份同时进行肠道病毒通用型、EV71、CA16检测的手足口病标本中, 肠道病毒通用型阳性1 155份(44.91%), EV71全年未检出, CA16阳性219份(8.51%), 非EV71非CA16肠道病毒阳性936份(36.39%);仅进行肠道病毒通用型检测的36 357份标本中, 阳性5 938份(16.33%)。非EV71非CA16肠道病毒的序列分析确定有14种型别, 其中CA6和CA10占44.14%(49/111)。结论 COVID-19疫情期间的2020年和2021年的肠道病毒阳性率低于疫情前的2019年。2019年至2021年手足口病的病原体以非EV71非CA16肠道病毒中的CA6和CA10为主。