心肌梗死相关miRNA-mRNA调控网络及其作用

目的 探讨心肌梗死相关的微小RNA(miRNA)-信使RNA(mRNA)调控网络,并分析其对心肌梗死发生发展的调控作用。方法 从基因表达数据库下载微阵列数据(GSE61741),用R语言进行差异分析,并对获得的差异表达miRNA进行上游转录因子及下游靶基因的预测;从GEO中获取GSE66360数据集,用R语言进行差异分析,将差异表达基因与靶基因取交集获得目标基因;对目标基因进行基因本体(GO)生物学功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,构建蛋白质相互作用(PPI)网络并筛选出Hub基因及核心miRNA。结果 共得到17个差异表达miRNA,其中4个表达上调、13个表达下调,其主要转录因子为2级POU结构域转录因子1、特异性蛋白1、早期生长反应1。差异表达miRNA靶基因与差异表达mRNA取交集共得到165个目标基因。GO富集分析发现其主要与细菌来源分子的反应、三级颗粒、细胞因子活性、趋化因子活性等生物过程和分子功能相关;KEGG通路富集分析显示目标基因主要聚集在TNF、IL-17、NF-κB等信号通路。miRNA-mRNA网络筛选出7个核心基因(JUN、CXCL8、FN1、NFKBIA、FOS、IL-1β、TNF)和5个核心miRNA(miR-34a-5p、miR-155-5p、miR-130a-3p、miR-129-2-3p、miR-24-3p)。结论 分析心肌梗死相关的miRNA-mRNA调控网络发现,miR-34a-5p、miR-155-5p、miR-130a-3p、miR-24-3p及其对应的CXCL8、FN1、NFKBIA、IL-1β、TNF在心肌梗死的发生发展及防治中发挥重要作用。