利用SNP标记进行上杭槐猪群体系谱构建研究

为了对新组建的上杭槐猪保种群实施有效管理,维持群体遗传多样性,本研究通过“中芯一号”50K芯片对229头上杭槐猪DNA样本进行基因分型,并下载杜洛克猪、大白猪、长白猪等西方商业猪种60K芯片数据,合并后进行群体遗传结构分析,重构上杭槐猪保种群系谱并对上杭槐猪公猪群进行家系划分。结果显示:该上杭槐猪保种群与西方商业猪种群体在遗传结构上有明显区别,其个体种质资源纯正,是良好的保种材料。在5次重复系谱构建中,229个基因型个体亲缘关系均相同,系谱早期的22个虚拟个体及其所属亲缘关系在5次重复中均保持一致从而被保留。上杭槐猪保种群中公猪个体之间的亲缘关系较远,可划分为8个家系进行保种管理。本研究表明,通过数量丰富的SNP数据对多世代上杭槐猪群进行系谱构建与公猪家系划分以进行群体保种管理,可为上杭槐猪群体的保种工作提供科学的指导与建议。