基于数据库分析自噬相关基因与卵巢癌不良预后的关系

基于数据库分析自噬相关的基因与卵巢癌(ovarian cancer,OC)不良预后的关系。通过GEO数据库GSE54388数据集筛选OC中的差异基因,GO数据库分析确认其中与自噬相关的基因,对其进行PPI、KEGG分析,并通过在线数据库确认与OC预后的关系。GSE5438数据集中有910个基因在卵巢癌中存在异常表达,GO分析结果显示其中共计13个基因与自噬相关,分别为CHMP4C、PTK2、LAMP3、HK2、ERN1、DCN、S100A8、SNCA、LGALS8、DAPK1、SYNPO2、GATA4、KDR。差异表达的自噬相关基因的GO和KEGG富集分析显示出与自噬、线粒体自噬相关的几个富集术语。在GEPIA数据库中,PTK2、HK2、S100A8和KDR在OC中无差异表达(P>0.05),而CHMP4C、LAMP3呈高表达(P<0.05),ERN1、DCN、SNCA、LGALS8、DAPK1、SYNPO2、GATA4呈低表达(P<0.05)。此外,高表达DAPK1的OC患者预后总生存率明显降低,这也提示DAPK1与OC的不良预后有关。通过生物学信息分析发现在OC中存在13个有差异表达的自噬相关基因,其中DAPK1与OC的不良预后有关,对于未来OC的诊治具有一定的应用价值。