肠道/口腔微生物组、血液代谢物等与胃癌相关性

目的比较胃癌患者与健康人肠道微生物、口腔微生物和血液代谢物的差异,寻找可能和胃癌相关的微生物。方法收集研究组(5例胃癌患者)和对照组(5例健康人)的粪便、唾液和血液样本,从粪便和唾液样本提取DNA用于宏基因组测序和后续生信分析,对血液样本检测与胃癌相关的10个临床指标。结果研究组肠道微生物和口腔微生物在属和种水平的Alpha多样性均低于对照组,但差异不具有统计学意义(P>0.05)。与对照组相比,研究组在肠道微生物中,属水平的乳杆菌属(Lactobacillu)和种水平的唾液乳酸杆菌(Lactobacillus salivarius)、咽峡炎链球菌(Streptococcus anginosus)等相对丰度差异具有统计学意义(P<0.05);线性判别分析(LEfSe)发现,肠道微生物上述指标有显著差异(LDA分值大于3);口腔微生物在属水平的弯曲杆菌属(Campylobacter)和奈瑟菌属(Neisseria)、种水平的Campylobacter concisus等相对丰度有显著差异(LDA分值为3)。相关性分析发现,研究组肠道微生物和口腔微生物中的Lactobacillus、肠球菌(Enterococcus)、链球菌属(Streptococcus)等属相对丰度均大于对照组,拟杆菌门(Bacteroides)等属的结果则相反。建模分析的结果表明,肠道微生物中的Lactobacillu属和口腔微生物中的兼性双球菌属(Gemella)属作为特征时,对照组和研究组曲线下面积(AUC)均可达到0.9。富集分析的结果发现,肠道微生物中,翻译、转录、膜转运、脂质代谢、异物生物降解与代谢等通路在研究组中显著富集。氨基酸代谢、能量代谢、碳水化合物代谢、辅助因子和维生素代谢等通路则在对照组中显著富集。口腔微生物中,异物生物降解和代谢、神经退行性疾病等通路在研究组显著富集。结论肠道微生物和口腔微生物中差异有共性,也有各自的特点。肠道微生物中的Lactobacillu属有可能是和胃癌相关的潜在生物标志。