欧亚葡萄品种“魏可”不同着色期果皮转录组差异分析

Analysis of Differences on Transcriptomes of Pericarps in Different Coloring Stages of Wink Grape

为探明欧亚葡萄“魏可”果皮转色过程在转录组水平上的变化,于果皮转色期、转色后15 d以及完熟期采集果实,获取果皮样品,利用RNA-Seq测序技术对转色过程中果皮基因表达变化规律进行探讨。结果表明,转色不同阶段果皮在转录组水平上存在显著差异表达基因。转色后15 d与转色期相比、完熟期与转色期相比以及完熟期与转色后15 d相比的显著差异基因数分别为3096、4444和1156个,且均含有显著上调和显著下调基因。GO富集分析表明,转色后15 d与转色期相比在整体上以及下调差异表达基因间存在显著富集过程,完熟期与转色期相比在整体上以及上下调差异表达基因间存在显著富集过程,完熟期与转色后15 d相比仅在上调差异表达基因间存在显著富集过程。鉴定出的KEGG富集代谢通路有10条,主要涉及光合作用和半乳糖代谢途径。转录因子分析共鉴定出62个转录因子基因家族的446个转录因子。“魏可”果皮转色过程在转录组水平上相关基因表达量存在显著变化,且GO和KEGG注释分析均鉴定出显著富集的过程及代谢途径,这为进一步大量挖掘与“魏可”葡萄果皮转色相关重要表达基因奠定了一定的基础。