东乡绿壳蛋鸡与白来航蛋鸡F2代资源群体鸡蛋蛋形指数性状变化规律及全基因组关联分析

本研究旨在分析鸡蛋蛋形指数变化规律,并探究影响该性状的候选基因,为其分子标记辅助选择提供参考依据。本实验利用由东乡绿壳蛋鸡和白来航蛋鸡构建的F2代母鸡为素材,测定开产、32、36、40、44、48、52、56、60、66、72周龄鸡蛋蛋形指数,分析其变化规律及遗传参数指标;同时提取基因组DNA,利用600 K基因芯片进行全基因组关联分析(Genome-wide Association Study, GWAS)。结果发现,周龄越大蛋形指数变异系数越大;各周龄蛋形指数遗传力在0.19~0.37之间,32~72周龄间蛋形指数的遗传相关在0.8以上,表型相关在0.4以上;在32、44、48周龄鉴定到与蛋形指数显著或潜在关联SNP位点8个,分别位于1、3、4号染色体上;多变量GWAS分析鉴定到在1、2、4号和17号染色体上SNP位点25个与蛋形指数潜在关联,筛选到ZDHHC2、SCG2、COG5和GPR107等候选基因;其中以位于4号染色体ADHHC2基因内含子区域的rs317038353位点对蛋形指数影响最大。综上,蛋形指数为中低遗传力,受微效多基因影响,其中ADHHC2为重要候选基因,研究结果为蛋形指数选择提供新的思路。