基于网络药理学研究厚朴抗结直肠癌的成分及机制

目的:基于网络药理学研究的基础,探讨厚朴的有效活性成分以及抗结直肠癌的作用机制。方法:在中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)中筛选厚朴的有效活性成分以及有效活性成分作用的靶点集合;在Genecards和OMIM数据库筛选出与结直肠癌相关的作用靶点集合;将上述两个集合取交集得到交集靶点基因;利用Cytoscape构建厚朴-有效活性成分-结直肠癌-交集靶点基因的网络图;利用R语言对这些交集靶点基因进行功能富集分析和信号通路分析;利用AutoDockTools对接软件,对厚朴中的有效活性成分新橙皮苷(Neohesperidin)与直接作用靶点(PTGS1编码蛋白)进行对接打分,以验证Neohesperidin与PTGS1编码蛋白的作用程度。结果:在TCMSP中共筛选到2个厚朴有效活性成分,且这两个有效活性成分共有10个作用靶点;从Genecards和OMIM数据库中共得到7925个与结直肠癌相关的基因;通过对从TCMSP和Genecards/OMIM数据库中得到靶点基因取交集,共得到6个有效活性成分治疗结直肠癌的交集靶点基因;利用Cytoscape画出厚朴-有效活性成分-结直肠癌-交集靶点基因的网络图;这些靶点基因主要与核受体结合、转录共激活活性相关,且主要受甲状腺激素信号通路、钙信号通路调节;从癌症基因组图谱(TCGA)数据库里共得到5301个与结直肠癌相关的差异基因,但与上述6个交集靶点基因的交集基因只有2个(PTGS1和ADRA1A);分子对接结果显示,关键有效活性成分Neohesperidin与关键基因PTGS1编码蛋白的B链的对接得分(-6.2)比与A链的对接得分(-4.7)更低。结论:厚朴治疗结直肠癌具有多成分、多靶点的特点,为结直肠癌的治疗提供新的临床数据。