玉竹根茎内生真菌的多样性及其生态功能预测

目的 分析玉竹根际土、根茎和根内真菌的群落组成以及物种多样性,预测根茎核心真菌群的生态功能,从而挖掘出与玉竹活性成分相关的功能菌群。方法 利用Illumina MiSeq高通量测序技术对玉竹根际、根茎和根内真菌ITS区的rDNA进行序列测定,测序分别获得有效序列68132、53254和69478条,可操作分类单元(OTUs)986、131和233个。将获得的OTUs通过FUNGuild软件对真菌群落进行功能分类。结果 (1)玉竹根际土真菌的物种总数和群落复杂程度高于内生真菌,内生真菌存在强优势菌,群落多样性较低。Cistella、镰刀菌属(Fusarium)、外瓶霉菌属(Exophiala)、Setophoma和新赤壳属(Neocosmospora)为药用部位根茎的优势菌属。(2)玉竹根茎中主要被分为5个功能类群,分别为未定义腐生菌、动物病原菌-未定义腐生菌、寄生真菌-植物病原菌-植物腐生菌、丛枝菌根和植物病原菌。其中Cistella和新赤壳属被划分为未定义腐生菌,外瓶霉属真菌被划分为动物病原菌-未定义腐生菌,Setophoma真菌被划分为寄生真菌-植物病原菌-植物腐生菌。另外,球囊菌门下所有真菌被划分为丛枝菌根。结论 玉竹根茎的核心真菌群主要包括镰刀菌属、新赤壳属、Setophoma、外瓶霉属和球囊菌门真菌,分析发现这些核心真菌群可能与玉竹活性成分的产生密切相关,这为玉竹生物施肥策略和品质提升提供了参考价值。