慢性阻塞性肺疾病中铁死亡相关特征基因的筛选及中药预测

目的利用生物信息学分析识别慢性阻塞性肺疾病(COPD)与铁死亡相关的关键基因,并预测可作用于这些靶点的中药。方法从基因表达数据库(GEO)检索并下载COPD数据集(GSE151052),使用R软件包DESeq2计算筛选差异表达基因(DEG),并进一步进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。采用WGCNA算法获得DEG关键模块,将关键模块中的基因集与铁死亡数据库(FerrDb v2)中的铁死亡相关基因取交集,得到差异表达的铁死亡相关核心基因(DE-FRG)。最后利用COREMINE数据库对DE-FRG进行中药预测。结果从COPD患者肺组织中筛选得到16个DE-FRG,功能富集分析显示这些基因主要集中在氧化应激通路;以DE-FRG为靶点预测出丹参、黄芪、五味子、茯苓等48种中药。结论丹参等中药的相关成分可能通过调控铁死亡相关基因的表达,影响肺组织的细胞铁死亡和炎症反应达到治疗慢性阻塞性肺病的作用。