人呼吸道合胞体病毒感染细胞中长链非编码RNA差异表达情况观察及生物学功能分析

目的观察人呼吸道合胞体病毒(RSV)感染的细胞中长链非编码RNA(lncRNA)的差异表达情况,并分析其生物学功能。方法采用RSV感染A549细胞,提取感染RSV的A549细胞RNA后,采用lncRNA表达谱芯片筛查lncRNA的差异表达谱,并采用实时荧光定量聚合酶链反应对其进行验证,通过GO和KEGG富集分析对差异lncRNA进行靶基因生物信息学分析。结果A549细胞感染RSV后共计2415个lncRNA发生差异表达,包括1453个上调lncRNA和962个下调ln-cRNA。其中,上调和下调最多的lncRNA分别为ENST00000607613.1(差异倍数=165.687)和ENST00000520156.1(差异倍数=23.562)。GO富集分析结果显示,差异表达的lncRNA调控靶基因主要与干扰素(Ⅰ型)信号转导、宿主抗病毒反应、病毒基因组复制的负调控等免疫反应生物学过程高度相关。生物信息学分析结果显示,18种lncRNA(P17101、P7539、P8209、P25918、P38638-v4、P8612、P8610、P34527-v4、P6011、P4480、P13713、P9969、P11891、P34635-v4、P12897、P8069、P3377、P30240)存在显著差异表达,且上述存在差异表达的lncRNA与RSV繁殖及干扰素调节过程具有高度相关性。提取RSV感染的A549细胞RNA并进行实时荧光定量聚合酶链反应验证发现,18种lncRNA相对表达水平分析结果与表达谱数据一致。结论RSV感染A549细胞后,lncRNA表达谱产生显著变化,差异化表达的lncRNA主要通过炎症反应和干扰素信号转导途径参与细胞对病毒感染的反应调控过程。