生物信息学分析肾小管间质纤维化关键基因及潜在治疗药物

Bioinformatics analysis of key genes and potential therapeutic agents for renal tubulointerstitial fibrosis

目的:利用生物信息学方法筛选肾小管间质纤维化关键基因,预测肾小管间质纤维化潜在治疗药物。方法:从基因表达数据库(GEO)下载GSE66494基因表达谱芯片数据,应用R软件筛选差异表达基因,STRING数据库构建蛋白质互作网络,Cytoscape软件筛选关键基因,GeneMANIA数据库进行功能富集分析,Connectivity Map(CMap)数据库预测潜在治疗药物。结果:共筛出337个差异表达基因,其中103个上调,234个下调。共筛选出DNA拓扑异构酶Ⅱα(TOP2A)、非SMC凝聚素Ⅰ复合亚基G(NCAPG)、母体胚胎亮氨酸拉链激酶(MELK)、泛素结合酶E2 C(UBE2C)、驱动蛋白家族成员20A(KIF20A)五个肾小管间质纤维化关键基因,其主要富集在细胞周期相关功能,共预测达拉菲尼、舒尼替尼、nutlin-3三种小分子化合物,可能对肾小管间质纤维化有治疗作用。结论:TOP2A、NCAPG、MELK、UBE2C、KIF20A关键基因可能与肾小管间质纤维化的发生发展密切相关。达拉菲尼、舒尼替尼、nutlin-3可为后续肾小管间质纤维化治疗药物研究提供参考。